WWW.DISS.SELUK.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА
(Авторефераты, диссертации, методички, учебные программы, монографии)

 

Квантово-химическое моделирование электронного возбуждения и релаксации в молекуле флуоресцентного зонда 4-диметиламинохалкона

На правах рукописи

САКОВИЧ Руслан Александрович

Квантово-химическое моделирование электронного возбуждения и

релаксации в молекуле флуоресцентного зонда 4-диметиламинохалкона

01.04.17 – химическая физика, горение и взрыв, физика экстремальных

состояний вещества

автореферат диссертации на соискание ученой степени

кандидата физико-математических наук

Москва – 2014

Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте химической физики им. Н. Н. Семнова Российской академии наук.

Научный руководитель: Романов Алексей Николаевич кандидат физико-математических наук НИВЦ МГУ, ведущий научный сотрудник

Официальные оппоненты: Дементьев Андрей Игоревич доктор физико-математических наук профессор, МПГУ, заведующий кафедрой Никитина Екатерина Александровна кандидат химических наук ИПРИМ РАН, старший научный сотрудник

Ведущая организация: Центр фотохимии РАН

Защита диссертации состоится «19» ноября 2014 г. в 11 часов на заседании диссертационного совета Д.002.012.02 при Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте химической физики им. Н. Н. Семнова Российской академии наук по адресу: 119991, г. Москва, ул. Косыгина, д. 4, корп. 1.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института химической физики им. Н. Н. Семнова Российской академии наук.

Автореферат разослан «17» сентября 2014 года.

Автореферат размещен на сайте Высшей аттестационной комиссии Министерства образования и науки Российской Федерации «13» августа 2014 года.

Учный секретарь диссертационного совета Д.002.012.02, кандидат физико-математических наук М. Г. Голубков

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность темы исследования. Флуоресцентные методы получили широкое распространение в медико-биологических исследованиях благодаря высокой чувствительности и простоте регистрации оптического сигнала.

Флуоресцентные красители окрашивают исследуемые клетки и ткани с помощью двух различных подходов: 1) химическая реакция, т.е. образование химической ковалентной связи между меткой и определенными химическими группами биологической структуры (перекрывание молекулярных орбиталей);

2) физико-химическое межмолекулярное взаимодействие – в этом случае краситель связывается с объектом неспецифически, как правило, за счет межмолекулярных сил физической природы. Именно по этому признаку в настоящее время принято разделять флуоресцентные красители на два основных класса: флуоресцентные метки и флуоресцентные зонды.

В первую группу попали те вещества, флуоресценция которых практически не реагировала на свойства окружения – их квантовый выход был близок к единице, что позволяло использовать минимальные концентрации метки. Однако из-за ограниченности активных химических групп, входящих в состав биологических структур, оставалась ниша для использования второго класса соединений. Для этих флуоресцирующих красителей не требовалось проведения химической реакции. Их связывание определялось физическими механизмами и подбиралось исследователями эмпирически. По мере накопления экспериментальных данных стало понятно, что распределение и изменение флуоресцентных свойств зондов можно использовать для оценки физико-химических свойств их окружения.

В 60-х годах 20 века делались многочисленные попытки установить связь между физико-химическими свойствами окружения и флуоресценцией зондов, и в этом направлении был достигнут значительный прогресс. Были предложены эмпирические и полуэмпирические модели, объясняющие спектральные сдвиги в спектрах флуоресценции красителей за счет сольватационного взаимодействия красителя с окружением. Предлагались специальные «шкалы растворителей», описывающие универсальные свойства флуоресценции красителей. Так была выделена группа флуоресцирующих соединений, чувствительность которых к физико-химическим свойствам окружения оказалась максимальна. Эта группа характеризовалась общей структурой и механизмом флуоресцентного ответа – это были молекулы с пространственным субъединицы. В основном состоянии молекула обладала разделением заряда, дополнительный внутримолекулярный перенос электронной плотности. Так как перенос заряда между донорной и акцепторной субъединицей зависит от диэлектрических свойств окружения, то это отражалось на оптических характеристиках флуоресцентных зондов.

Начиная с 1980-х годов, делались попытки объяснить флуоресцентные свойства молекул зондов, использовавшихся в биологии, медицине и химии, при помощи компьютерного моделирования свойств молекул – квантовой химии. В основу методов расчетов свойств молекул легли уравнения квантовой физики.

Цели и задачи. Цель настоящей работы заключалась в теоретическом обосновании зависимости оптических параметров флуоресцентного зонда 4диметиламинохалкона (ДМХ) в возбужденном состоянии от физикохимических свойств его окружения при помощи методов квантовой химии. Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи:

Выяснить характер нижних электронно-возбужденных состояний и структуру поверхностей потенциальной энергии изучаемого зонда с помощью различных методов квантовой химии.

Исследовать изменения поверхностей потенциальной энергии нижних возбужденных состояний при взаимодействии зонда с молекулами окружения и обосновать их влияние на оптические свойства.

неадиабатические процессы, происходящие в возбужденных состояниях молекулы флуоресцентного зонда. Оценить таким образом скорости безызлучательной релаксации. Изучить влияние молекул окружения на эти процессы.

Научная новизна. Для исследования всего каскада фотофизических процессов, ответственных за оптические свойства флуоресцентного зонда впервые был использован комплексный подход: квантово-химическое моделирование процессов связывания, расчет параметров поглощения света и флуоресценции. На каждом этапе работ отбирались, тестировались и использовались методы и модели, оптимальные для решения конкретной задачи. Критерием адекватности их использования служило сравнение с экспериментальными данными. Методика, разработанная в ходе выполнения работ, безусловно, может являться основной для построения будущих моделей.

Для исследования процессов релаксации возбужденного состояния неадиабатический молекулярной динамики. Этот подход является новым, поскольку выполнение такого рода расчетов стало возможным только в последнее время, благодаря запуску в МГУ суперкомпьютера «Ломоносов». В работе впервые установлены структурные параметры молекулы, ответственные за конкуренцию излучательных и безызлучательных процессов, лежащих в основе формирования квантового выхода флуоресценции зонда в мембране клетки.

Теоретическая и практическая значимость. Понимание механизмов, ответственных за квантовый выход флуоресценции зонда ДМХ, является ключевым источником информации о физико-химической структуре клеточных мембран. Связь структуры молекулы зонда и взаимодействия флуорофора с окружением с флуоресцентными свойствами, выясненная в ходе выполнения работы, позволяет установить физические параметры мембран клетки и проследить за их изменениями при патологии. Кроме того, доказано, что взаимодействие зонда ДМХ со связанными молекулами воды в гидрофобных «карманах» белков и неполярных областях клеточных мембран является причиной увеличения интенсивности флуоресценции и смещения ее спектра в красную область. Полученные закономерности могут стать основой для разработки количественного наноиндикатора наличия и роли молекул воды в формировании биологических молекулярных структур.

Методология и методы исследования. В работе использовались различные ab initio методы квантовой химии, а также проводилось компьютерное моделирование молекулярной динамики изолированной молекулы флуоресцентного зонда ДМХ и ее комплексов с молекулами воды.

Положения, выносимые на защиту:

Определена структура ППЭ и свойства нижних электронных уровней изолированной молекулы флуоресцентного зонда ДМХ в вакууме.

квантового выхода флуоресценции ДМХ в неполярных средах.

Рассчитаны энергии водородных связей между молекулами ДМХ и воды в основном и возбужденном состояниях. Изучено влияние молекул окружения с протон-донорными группами на квантовый выход флуоресценции ДМХ.

изолированной молекулы ДМХ и ее комплексов с молекулами воды.

Степень достоверности полученных результатов. Достоверность результатов квантово-химических расчетов, изложенных в работе, подтверждается соответствием с экспериментальными данными. Созданная и представленная в настоящей работе модель позволила предсказать оптические экспериментального подтверждения.

представлены автором в виде докладов на конференции молодых ученых ИХФ конференции молодых ученых НИИ ФХМ (Москва, 2013).

Личный вклад автора. Все квантово-химические расчеты, лежащие в основе данной работы, выполнены автором или при его непосредственном участии. Весомым является так же вклад автора в постановку научной задачи и выбор методов ее решения. Автор принимал непосредственное участие в обработке данных расчетов и анализе полученных результатов.

Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из обзора литературы, результатов и их обсуждения, выводов, списка сокращений и списка цитируемой литературы из 117 наименований. Работа изложена на страницах машинописного текста, содержит 28 рисунков и 12 таблиц.

Публикации. По материалам диссертационной работы опубликовано печатных работы, в том числе 4 статьи из списка журналов, рекомендованных ВАК.

ОСНОВНОЕ СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

В первой главе дается краткое описание методов квантовой химии, использованных в работе, и проводится литературный обзор работ, посвященных расчету возбужденных состояний органических флуорофоров.

Первым флуоресцентным зондом, предложенным в СССР, была молекула незаряженного красителя 4-диметиламинохалкона (ДМХ) (рис. 1). В 1972 году Ю.А. Владимиров использовал его для регистрации конформационных изменений молекулы транспортного белка крови – альбумина.

В дальнейших исследованиях было показано, что такие свойства молекулы ДМХ, как отсутствие заряда и гидрофобность, делают ее очень удобным инструментом в исследовании мембран. Коэффициент распределения молекулы ДМХ в двухфазной системе вода-гептан составляет порядка 1:1000.

Кроме того, было показано, что избирательность для гидрофобных областей биологических объектов – не самое важное свойство нового флуоресцентного зонда. Таким образом, наблюдая за флуоресценцией зонда, добавленного к суспензии мембран, мы наблюдаем лишь за теми молекулами, которые благодаря гидрофобным взаимодействиям проникли внутрь мембраны.

При исследовании биомембран с помощью флуоресценции зондов выяснилась одна из основных проблем метода: даже в таком простом объекте, как модельные липидные мембраны из химически однородного фосфолипида, параметры флуоресценции прямо или косвенно указывают на наличие гетерогенности, которой не наблюдается в растворителях. На сегодняшний день нет единой биофизической концепции, объединяющей и объясняющей все особенности флуоресценции зондов в мембранах. Так как этот вопрос является принципиальным для понимания процессов, которые регистрируются с помощью флуоресценции зондов, то ему было уделено особое внимание в настоящей работе.

Прежде всего, предстояло выяснить причину столь значительного влияния свойств окружения зонда ДМХ на его флуоресцентные параметры. В первую очередь это относится к изменениям в спектре флуоресценции и величине квантового выхода, которые у зонда ДМХ варьируются значительно сильнее, чем у других аналогичных флуорофоров. Для решения этой задачи выбор квантово-химического моделирования предоставил уникальные возможности. Только с помощью этих методов можно доказать существование устойчивых конформеров у молекулы ДМХ в возбужденном состоянии.

Другой, еще более актуальной проблемой являлось установить причину наблюдаемых в эксперименте более чем 1000 кратных изменений квантового выхода зонда. Планировалось, что экспериментальные данные, предполагающие существование в неполярных средах синглет – триплетного перехода, будут, во-первых, подтверждены расчетами структуры уровней в возбужденном состоянии, а во-вторых, с помощью молекулярной динамики интеркомбинационной конверсии. Экспериментальные данные позволяли оценить лишь суммарное время нескольких переходов электронновозбужденного состояния ДМХ.

Огромный интерес представлял также вопрос о взаимодействии мембранного зонда ДМХ с молекулами воды. Молекулы воды всегда присутствуют в структуре мембран и белков биологических объектов. Ранее предполагалось, что молекулы воды являются причиной тушения флуоресценции ДМХ, однако последние модельные исследования показали, что это не всегда выполняется. Действительно, в полярном окружении образование водородной связи вызывает резкое падение флуоресценции, но в неполярной среде наблюдается противоположный эффект. Чем обусловлены эти процессы и какова их природа? Решению этих задач в настоящей работе посвящена отдельная глава.

Во второй главе рассматриваются различные квантово-химические методы расчета возбужденных состояний в применении к молекуле зонда ДМХ и выбирается наиболее подходящий для выполнения поставленных задач метод.

В настоящее время не существует универсального метода расчета возбужденных состояний органических молекул средней величины, поэтому первоочередной задачей квантово-химического исследования является сравнение результатов различных методов расчета. Методами CIS, CASSCF, RASSCF, CASPT2, EOM-CCSD, TDDFT и RI-CC2 были выполнены расчеты энергий вертикальных переходов изолированной молекулы ДМХ с основного на нижние электронно-возбужденные состояния. Геометрия молекулы во всех этих расчетах была одинакова и соответствовала минимуму ППЭ основного состояния, полученному методом RI-CC2. Во всех случаях для этих вычислений был использован базис cc-pVDZ или его аналог SVP. Наиболее существенные результаты этих расчетов, а так же экспериментальные значения, полученные для раствора ДМХ в гексане, приведены в таблице 1.

Таблица 1. Энергия основного состояния и энергии вертикальных переходов молекулы ДМХ из основного состояния, полученные при расчетах различными методами.

Как видно из таблицы 1, наилучшее согласие с экспериментальными данными показали расчеты методами CASPT2, TDDFT (с функционалом pbe0), ADC(2) и RI-СС2. Совпадение результатов, полученных в рамках этих методов для базисов одинакового качества (cc-pVDZ для CASPT2 и SVP для TDDFT, ADC(2) и RI-CC2) свидетельствует о хорошей сходимости решений независимо конфигураций. Однако, результаты расчета методом TDDFT оказались существенно зависимы от выбора функционала. У методов ADC(2) и RI-CC есть ряд преимуществ перед методом CASPT2. Во-первых, в них отсутствует произвол в выборе активного пространства, а во-вторых, вычислительные затраты при использовании этих методов существенно ниже, чем при использовании CASPT2. Существенно меньшее время расчета позволяет использовать методы ADC(2) и RI-CC2 с базисами более высокого качества – TZVP и QZVP. Как видно из таблицы 1 изменение базиса с SVP на TZVP приводит к существенному улучшению результатов, изменение же с TZVP на QZVP улучшает результаты в меньшей степени. Таким образом, в качестве основного метода для дальнейших расчетов был выбран метод RI-CC2.

В третьей главе излагаются результаты расчета нижних возбужденных состояний изолированной молекулы ДМХ в вакууме, и дается объяснение низкому квантовому выходу флуоресценции ДМХ в вакууме и неполярных средах.

необходимо знать свойства его возбужденных состояний. С этой целью в рамках метода RI-CC2 были рассчитаны вертикальные переходы из минимума на ППЭ основного состояния на нижние возбужденные синглетные и триплетные уровни.

Оказалось, что первое электронно-возбужденное синглетное состояние имеет преобладающий характер n *. Величина силы осциллятора для этого перехода составляет 0,039. Таким образом, вероятность его заселения непосредственно в результате поглощении фотона невысока, однако его присутствие отмечается на спектрах поглощения раствора ДМХ в некоторых неполярных растворителях.

Второе электронно-возбужденное синглетное состояние по характеру является *. Высокое значение силы осциллятора этого перехода равное 1,005 а, следовательно, и большое значение коэффициента молекулярной экстинкции, позволяет предположить, что именно он будет реализовываться при поглощении фотона молекулой ДМХ.

В некоторых случаях флуоресцентный зонд ДМХ после фотовозбуждения переходит в триплетное состояние. Спектры фосфоресценции зонда, полученные при температуре жидкого азота в гексане, не только доказывают вероятность этого перехода, но и позволяют оценить энергетические характеристики триплетного уровня. В этой связи, синглет триплетный переход ДМХ исследовался дополнительно. Результаты расчетов показали, что первое триплетное состояние расположено по энергии ниже синглетных и имеет Также был выполнен поиск геометрий, соответствующих минимумам на ППЭ 1(n, *), 1(, *) и 3(, *) состояний. Поиск этих точек на поверхности ППЭ необходим по двум причинам: во-первых, близость поверхностей потенциальной энергии различных состояний в минимуме одного из них состояния молекулы, во-вторых, представляется возможность оценить энергию теоретических расчетов с экспериментальными данными. Значения энергий и дипольных моментов в оптимальных геометриях основного и нижних электронно-возбужденных состояниях приведены в таблице 2.

Таблица 2. Дипольные моменты и энергии относительного основного состояния в геометриях, отвечающих минимума на ППЭ соответствующих возбужденных состояний, Как видно из таблицы 2, возбужденному состоянию синглетного 1(, *) уровня соответствует высокая величина дипольного момента, что объясняется значительным вкладом структуры с переносом заряда (рисунок 2а) в общую изменения в сторону альтернации С-С связей в полиеновой цепи. Анализ молекуле ДМХ проявляет характер бирадикала (рисунок 2б). Так, при карбонильной группы. В пользу этого свидетельствует также альтернация порядка двойных и одинарных связей.

Рис. 2. Возможные структуры изолированной молекулы ДМХ в возбужденных состояниях:

диэдральный угол между плоскостями, в которых лежит диметиламиногруппа зонда и остальная часть молекулы, составляет 0°. Иными словами, диметиламиногруппа зонда находится в плоскости остальной части молекулы.

Ранее в ряде исследований предполагалось, что флуоресцентные свойства флуорофоров, сходных по структуре с молекулой мембранного зонда ДМХ, во многом определяются подвижностью диметиламиногруппы и существованием твист-конформеров. Для проверки гипотезы о существовании устойчивой конфигурации с поворотом диметиламиногруппы в 1(, *) возбужденном состоянии была проведена серия оптимизаций геометрий с зафиксированными значениями угла в промежутке от 0° до 90°. Вычислив энергии вертикальных переходов на нижние электронно-возбужденные синглетные и основное состояния в каждой геометрии и приняв за ноль наименьшую абсолютную энергию основного состояния, можно получить зависимость энергии основного и нижних возбужденных синглетных состояний от угла (рисунок 3).

Рис. 3. Зависимость энергии основного и нижних возбужденных синглетных состояний от Как видно из графика, при увеличении угла наблюдается возрастание энергий как основного, так и возбужденных состояний. При повороте диметиламиногруппы на 90° энергии основного, 1(n, *) и 1(, *) состояний повышаются на 0,2 эВ, 0,1 эВ и 0,4 эВ соответственно. Таким образом, возбужденные состояния молекулы ДМХ с выходом диметиламиногруппы из плоскости молекулы не являются устойчивыми. Кроме того, оптимизация геометрии ДМХ при старте из точки с перпендикулярной ориентацией диметиламиногруппы без фиксации координат приводит ДМХ в исходное плоское состояние, что свидетельствует об отсутствии другого минимума.

Для того чтобы предположить возможные варианты пути релаксации соответствующих минимумам ППЭ основного, 1(n, *), 1(, *) и 3(, *) состояний, были рассчитаны энергии вертикальных переходов на остальные три состояния, и построена структура ППЭ четырех исследуемых электронных состояний молекулы ДМХ (рис. 4). На рисунке белыми точками обозначены положения глобальных минимумов ППЭ, а черными — точки, полученные при расчете энергий вертикальных переходов. Расстояния между точками по вертикали соответствуют энергии, а горизонтальные расстояния выбраны произвольно.

Рис. 4. Структура основного и нижних электронно-возбужденных электронных уровней изолированной молекулы ДМХ. Белыми точками обозначены положения глобальных минимумов на ППЭ, а черными — точки, полученные при расчете Как отмечалось выше, при поглощении фотона молекула ДМХ переходит в возбужденное 1(, *) состояние. В результате этого возбуждения дипольный момент зонда возрастает с 5,5 до 16,8 Дебай. Далее, в процессе релаксации структуры в геометрию, оптимальную для 1(, *) состояния, дипольный момент ДМХ возрастает всего до 17,1 Дебай. Как видно из рисунка 4, непосредственно вблизи минимума ППЭ состояния 1(, *) проходит терм 1(n, *). Разница энергии этих уровней составляет лишь E1=0,14 эВ. В результате такой близости двух термов происходит быстрое и эффективное заселение 1(n, *) состояния (внутренняя конверсия).

В дальнейшем, в процессе релаксации структуры молекулы по ППЭ 1(n, *) состояния, происходят существенные преобразования геометрии – изменяются углы и длины связей (см. таблицу 4), а дипольный момент ДМХ падает до 2,0 Дебай. В районе минимума ППЭ терм 1(n, *) пересекается с ППЭ триплетного уровня 3(, *) – полученная методом RI-СС2 разница энергий составляет E2=0,13 эВ. Вычисление при помощи метода CI в пакете Molpro спин-орбитального матричного элемента гамильтониана между состояниями (n, *) и 3(, *) дает результат 1,5 см-1. В таких случаях интеркомбинационная конверсия может протекать достаточно эффективно.

Таким образом, результаты расчетов показывают, что в молекуле ДМХ после первоначального акта электронного возбуждения на уровень 1(, *) в достаточно быстро происходит заселение нижнего триплетного 3(, *) уровня.

По экспериментальным оценкам, полученным в последнее время, зонд ДМХ переходит в нижнее триплетное состояние за несколько пикосекунд.

В четвертой главе рассматриваются различные комплексы ДМХ с молекулами воды, и доказывается, что образование комплекса с одной или двумя молекулами воды, координированными по кислороду карбонильной группы ДМХ, приводит к повышению квантового выхода флуоресценции.

Для анализа оптических параметров флуоресцентных меток и зондов часто Наблюдаемые закономерности параметров флуорофора позволяют выявить универсальные физические механизмы, основанные на диполь-дипольной теории взаимодействия. В некоторых растворах, однако, наблюдаются существенные отклонения от такого универсального характера влияния среды на флуорофор. В этих случаях принято считать, что молекулы флуорофора образуют специфические комплексы с молекулами растворителя. Такие комплексы возможны только между определенными химическими группами молекул флуорофора и его окружения.

межмолекулярное взаимодействие вносит стерический фактор, т.е. особенности структуры исследуемой молекулы флуорофора. Этот вклад трудно оценить экспериментально, поэтому в данной работе сделана попытка оценить роль специфических взаимодействий зонда ДМХ и его окружения с помощью квантово-химических методов.

У молекулы ДМХ есть несколько участков доступных для образования устойчивой водородной связи с молекулой воды: кислород карбонильной диметиламиногруппы (рисунок 5б, комплекс 1N). Кроме того, карбонильная группа ДМХ может образовывать сразу две водородных связи (рисунок 5в, комплекс 2O).

Рис. 5. Возможные комплексы ДМХ с молекулами воды: а) комплекс с одной молекулой воды, координированной по кислороду карбонильной группы ДМХ, б) комплекс с одной молекулой воды, координированной по азоту диметиламиногруппы, в) комплекс с двумя молекулами воды, координированными по кислороду ДМХ.

Для всех устойчивых комплексов ДМХ с водой были найдены геометрии, отвечающие минимумам ППЭ как основного, так и нижних возбужденных синглетных и триплетного состояний. Кроме того, была определена природа возбужденных уровней в геометриях, отвечающих минимуму ППЭ основного состояния. Оказалось, что у комплекса 1N характер возбужденных уровней совпадает с характером уровней изолированной молекулы ДМХ: нижний комплексов 1O и 2O, наоборот, нижний возбужденный синглетный уровень В таблице 4 приведены рассчитанные дипольные моменты комплексов, в геометриях, отвечающих минимумам ППЭ основного и нижних возбужденных электронных состояний. Высокое значение величины дипольного момента для состояния 1(, *), по-видимому, свидетельствует о том, что в этом состоянии происходит внутримолекулярный перенос заряда, как описано ранее.

Образование комплекса между молекулой воды и азотом диметиламиногруппы ДМХ существенно уменьшает величины дипольных моментов как в основном, так и в возбужденных состояниях. В то же время, гидратирование карбонильной группы ДМХ одной, и особенно двумя, молекулами воды увеличивает дипольный момент.

Таблица 4. Дипольные моменты комплексов (Дебай) в конфигурациях, отвечающих основному и возбужденным состояниям для различных молекулярных комплексов ДМХ и Проведенные расчеты позволили предложить упрощенную схему поверхностей потенциальных энергий основного и нижних электронновозбужденных состояний для всех комплексов (рисунок 6).

Рис. 6. Условная схема ППЭ нижних электронных уровней молекулы ДМХ в вакууме (а) и ее комплексов с различной координацией молекул воды: б – 1N, в – 1O, г – 2O.

Для комплекса 1N (рис. 6б) относительное расположение ППЭ нижних электронно-возбужденных состояний сходно с расположением ППЭ нижних электронно-возбужденных состояний изолированной молекулы ДМХ в вакууме (рис. 6а) и, следовательно, процесс релаксации комплекса 1N будет схож с релаксацией изолированной молекулы ДМХ: после фотовозбуждения в происходит заселение нижнего триплетного 3(, *) состояния.

Для комплекса 1O (рис. 6в) в геометрии, соответствующей минимуму ППЭ основного состояния, нижним возбужденным синглетным состоянием находится ниже глобального минимума на ППЭ 1(, *) состояния. Таким образом, после поглощения фотона комплекс 1O переходит в 1(, *) состояние.

Далее, в результате колебательной релаксации он может попадать в минимум на ППЭ 1(, *), и оттуда становится возможной флуоресценция, либо из-за того, что вблизи минимума ППЭ 1(, *) состояния проходит терм 1(n, *) становится возможной безызлучательная релаксация на синглетный (n, *) уровень и дальнейшая колебательная релаксация в минимум ППЭ. Вблизи минимума ППЭ 1(n, *) происходит пересечение с термом 3(, *) и возможна эффективная интеркомбинационная конверсия.

У комплекса 2O (рис. 6г) состояние 1(, *) расположено ниже 1(n, *) во всех исследованных геометриях. Это позволяет предположить, что после фотовозбуждения происходит релаксация в минимум ППЭ 1(, *), в котором комплекс может находиться достаточно долго, и вероятность излучательного перехода в основное состояние (флуоресценции) высока.

Таким образом, полученные данные свидетельствуют о том, что изменение относительного расположения возбужденных уровней молекулы ДМХ происходит при координации первой и второй молекул воды по кислороду карбонильной группы. Образование комплекса с молекулой воды по атому азота ДМХ не изменяет структуру возбужденных уровней.

В пятой главе излагаются результаты проведенного моделирования молекулярной динамики изолированной ДМХ и ее комплексов с молекулами воды, и предлагается объяснение высокого квантового выход флуоресценции ДМХ в ригидных средах.

Образование водородных связей в неполярном окружении приводит к инверсии электронно-возбужденных 1(, *) и 1(n, *) уровней, что приводит к экспериментальных данных известно, что в водном растворе квантовый выход ДМХ оказывается близким к нулю. Кроме того, в чистых апротонных растворителях квантовый выход флуоресценции ДМХ монотонно растет с увеличением полярности окружения до некоторого предела, а затем начинает снижаться. Такая зависимость может объясняться наличием конкурирующего с флуоресценцией процесса безызлучательной релаксации возбужденного состояния ДМХ, скорость которого резко возрастает с увеличением полярности. В данной части работы была осуществлена проверка этой гипотезы при помощи метода моделирования молекулярной динамики.

Для изолированной молекулы ДМХ, комплекса ДМХ с одной (комплекс 1O) и двумя молекулами воды (комплекс 2O), координированными по кислороду карбонильной группы, производился расчет 100 траекторий молекулярной динамики длиной 500 фс каждая, с шагом 0,5 фс. Начальные условия для каждой из траекторий были различны и определялись при помощи процедуры Монте-Карло из распределения Вигнера для нулевого колебательного уровня основного состояния многомерного гармонического осциллятора. Для моделирования взаимодействия со средой использовалась процедура термостатирования Андерсена с интервалом времени 5 фс и температурой К. Расчет потенциальной энергии межатомного взаимодействия осуществлялся при помощи метода TDDFT с функционалом bh-lyp.

Для оценки кинетического параметра перехода молекулярной системы из первого возбужденного в основное состояние использовались вероятности этого перехода, вычисляемые на каждом шаге интегрирования квантовомеханических амплитуд, характеризующих нахождение системы в различных электронных состояниях. Начальный участок кривой распада возбужденного состояния можно построить, определив временную зависимость вероятности Pп перехода в основное состояние (заселенность основного состояния) после N шагов молекулярной динамики:

Здесь pi – вероятности неадиабатического перехода в основное состояние на каждом шаге молекулярной динамики. Вероятность для ансамбля траекторий находится путем усреднения вероятности по траекториям. Поскольку время моделирования значительно меньше характерного времени распада возбужденного состояния 0, полученная временная зависимость вероятности близка к прямой, являющейся касательной к экспоненте распада в точке t=0.

Тангенс наклона этой прямой tg, откуда можно оценить характерное время распада возбужденного состояния путем релаксации в основное.

На рисунке 7 приведены графики временной зависимости заселенности основного состояния при неадиабатическом переходе с первого возбужденного состояния. Показаны результаты для изолированной молекулы ДМХ и ее комплексов с одной и двумя молекулами воды.

Рис. 7. Временные зависимости заселенности основного состояния (полученные усреднением по 100 индивидуальным траекториям) для изолированной молекулы Данные, полученные для изолированной молекулы ДМХ, значительно отличаются от результатов для комплексов зонда с молекулами воды.

Вероятность неадиабатического перехода составила всего 1,610-3 за 0,5 пс.

Постоянная времени этого процесса была оценена путем линеаризации кривой на участке от 50 до 500 фс и составила 350 пс. Ранее было показано, что для изолированной молекулы ДМХ характерное время конкурирующего процесса интеркомбинационной конверсии с уровня 1(n, *) на 3(, *), составляет всего около 7 пс, поэтому можно считать, что в этом случае моделируемый канал безызлучательной релаксации имеет лишь второстепенное значение.

Для обоих комплексов молекулы ДМХ с водой нижним возбужденным является синглетный 1(, *) уровень. Триплетный уровень 3(n, *) в этом случае расположен выше по энергии и интеркомбинационная конверсия невозможна. Поэтому для комплексов зонда с молекулами воды депопуляция нижнего синглета осуществляется в результате двух параллельных процессов:

излучательного и безызлучательного.

Как видно из графика, за время наблюдения 0,5 пс для комплексов 1O и 2O величины вероятности заселения основного состояния оказались близкими — 5,510-3 и 6,210-3 соответственно. Постоянная времени безызлучательного перехода, рассчитанная для комплексов ДМХ с одной и двумя молекулами воды путем линейной аппроксимации на участке от 50 фс до 500 фс составила соответственно 96 пс и 86 пс.

безызлучательного перехода, исследовалась связь величины вероятности со структурными параметрами молекулы ДМХ. Анализ проводили на выборке из ансамбля конформеров, полученных в процессе молекулярно-динамического моделирования. Оказалось, что изменение длин C-C связей, входящих в полиеновую цепочку, достаточно сильно влияет на вероятность перехода S1S0 (на рис. 8 кружками изображена такая зависимость для одной из С-С геометрических параметров практически не коррелируют с вероятностью перехода (на рис. 8 треугольниками показана типичные такая зависимость).

Рис. 8. Зависимость средней вероятности неадиабатического перехода от отклонения длин различных связей от равновесного значения, построенная для ансамблей молекулярных конформаций, полученных при движении системы по 100 независимым траекториям Наиболее яркой оказалась зависимость вероятности безызлучательного перехода от скорости изменения геометрических параметров молекулы ДМХ.

Причем, эта зависимость отличается для изолированной молекулы зонда и двух исследованных комплексов с молекулами воды. Как следует из результатов, показанных на рис. 9, вероятность безызлучательного перехода для комплексов 1O и 2O всегда выше, чем для изолированной молекулы ДМХ.

Рис. 9. Зависимость средней вероятности неадиабатического перехода от изменения длины одной из С-С связей в полиеновой цепи за один шаг молекулярной динамики.

Таким образом, в основе механизма безызлучательной релаксации (внутренней конверсии) флуоресцентного зонда лежит колебательная подвижность полиеновой цепи его молекулы. Этот участок сопрягает донорную и акцепторые субъединицы молекулы и является ключевым звеном, ответственным за квантовый выход флуоресценции зонда. Возможно, деформация именно этого участка молекулы ДМХ может в значительной степени определять эффективность безызлучательной релаксации. Эта гипотеза подтверждается экспериментальными данными: в ригидных средах, ограничивающих колебания молекулы зонда, скорость безызлучательной релаксации молекулы ДМХ существенно снижается. Вероятно, именно с этим связан высокий квантовый выход флуоресценции – 0,6, в то время как в жидких средах (органических растворителях), его величина не превышает 0,2.

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ

Теоретическая модель процессов фотовозбуждения и релаксации, построенная квантово-химическими методами, позволила доказать, что причиной низкого квантового выхода флуоресценции ДМХ в неполярном интеркомбинационной конверсии.

Впервые показано, что образование комплекса с одной или двумя молекулами воды, координированными по кислороду карбонильной группы ДМХ, приводит к повышению квантового выхода флуоресценции за счет изменения характера первого возбужденного синглетного состояния.

При помощи методов молекулярной динамики установлено, что неадиабатическое вибронное взаимодействие первого возбужденного синглетного и основного состояния молекулы ДМХ обусловлено колебаниями атомов полиеновой цепи. Это взаимодействие в комплексах ДМХ с молекулами воды ведет к внутренней конверсии с характерным временем порядка 100 пс.

Основное содержание диссертации изложено в работах:

1. Romanov A.N., Gularyan S.K., Polyak B.M., Sakovich R.A., Dobretsov G.E., Sarkisov O.M. Electronically excited states of a membrane fluorescent probe 4dimethylaminochalcone. Results of quantum chemical calculations // Physical Chemistry Chemical Physics. — 2011. — V. 13. — N. 20. — P. 9518-9524.

Сакович Р.А., Поляк Б.М., Гуларян С.К., Романов А.Н., Светличный В.Ю., Саркисов О.М. Взаимодействие мембранного флуоресцентного зонда 4диметиламинохалкон с гидроксильными группами окружения: квантовохимическое моделирование // Известия Российской Академии Наук. Серия Химическая. — 2013. — N. 5. — С. 1142-1154.

Сакович Р.А., Романов А.Н., Гуларян С.К., Поляк Б.М., Шмаков П.А., Гостев Ф.Е., Шелаев И.В. Когерентное управление процессами релаксации возбужденного состояния в молекуле флуоресцентного зонда 4диметиламинохалкона. Квантово-химическое моделирование // Вычислительные методы и программирование. — 2013. — Т. 14. — С. 432-437.

4. Polyak B.M., Sakovich R.A., Gularyan S.K., Romanov A.N., Isakova S.I.

Modeling processes of non-radiative relaxation of electronically excited states of fluorescent probe 4-dimethylaminochalcone with non-adiabatic molecular dynamics // Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry. — 2014. — V. 278. — P. 89-96.





Похожие работы:

«Поспелов Евгений Анатольевич ЧИСЛЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ НЕРАВНОВЕСНОГО КРИТИЧЕСКОГО ПОВЕДЕНИЯ СТРУКТУРНО НЕУПОРЯДОЧЕННЫХ СИСТЕМ 01.04.02 – теоретическая физика Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Омск – 2014 Работа выполнена на кафедре теоретической физики Омского государственного университета им. Ф.М. Достоевского. Научный руководитель : доктор физико-математических наук, профессор Прудников Владимир Васильевич. Официальные...»

«Смирнова Екатерина Ивановна Метод квазиклассических траекторно-сосредоточенных функций для двухкомпонентного уравнения типа Хартри Специальность 01.01.03 – математическая физика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва – 2010 Работа выполнена на кафедре прикладной математики Московского государственного института электроники и математики (технического университета) Научные руководители: доктор физико-математических наук,...»

«Крылатов Александр Юрьевич Математическое моделирование распределения транспортных потоков Специальность 01.01.09 — Дискретная математика и математическая кибернетика Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Санкт-Петербург 2014 Работа выполнена в Санкт-Петербургском государственном университете. Научный руководи- доктор физико-математических наук, протель: фессор Захаров Виктор Васильевич Официальные оппо- Луценко Михаил...»

«Гарнаева Гузель Ильдаровна ОПТИЧЕСКИЕ ПЕРЕХОДНЫЕ ЭФФЕКТЫ В ПРИМЕСНЫХ КРИСТАЛЛАХ ПРИ НАЛИЧИИ ВНЕШНИХ НЕОДНОРОДНЫХ ЭЛЕКТРОМАГНИТНЫХ ПОЛЕЙ Специальность 01.04.05 - оптика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Казань – 2009 - 2 Работа выполнена на кафедре общей и экспериментальной физики физического факультета Государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования Татарский государственный...»

«МАКУРЕНКОВ Александр Михайлович СПЕКТРАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ОСОБЕННОСТЕЙ ПРОЦЕССОВ СОРБЦИИ В РАЗБАВЛЕННЫХ РАСТВОРАХ Специальность 01.04.05 – оптика Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва – 2012 Работа выполнена на кафедре медицинской физики Физического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова Научный руководитель : доктор физико-математических наук профессор Петрусевич Юрий Михайлович Научный консультант : доктор...»

«Рыкунов Алексей Александрович ПЕРЕНОСИМОСТЬ КВАНТОВО-ТОПОЛОГИЧЕСКИХ АТОМНЫХ И СВЯЗЕВЫХ ДЕСКРИПТОРОВ В РЯДУ ЗАМЕЩЕННЫХ ГИДРОПИРИМИДИНОВ специальность 02.00.04 — физическая химия АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук Москва — 2011 Работа выполнена на кафедре квантовой химии факультета естественных наук Российского химико-технологического университета им. Д.И. Менделеева Научный руководитель : доктор физико-математических наук, профессор...»

«ЛУНЁВ ИВАН ВЛАДИМИРОВИЧ ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРЫ И ДИПОЛЬНОЙ ПОДВИЖНОСТИ ВОДОРОДОСВЯЗАННЫХ РАСТВОРОВ МЕТОДОМ ВРЕМЕННОЙ ДИЭЛЕКТРИЧЕСКОЙ СПЕКТРОСКОПИИ Специальность 01.04.03 – радиофизика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Казань – 2007 Работа выполнена на кафедре радиоэлектроники Казанского государственного университета. кандидат физико-математических наук, Научный руководитель : доцент Ю.А. Гусев; кандидат...»

«УДК 577.353.2 КАРПОВА ЛАРИСА ВИКТОРОВНА Участие -изоформ Na,K-АТPазы в активации Erk1/2 киназы в нейрональных и подобных им клетках АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Специальность 03.01.04 – биохимия Москва, 2010 Работа выполнена на кафедре биохимии Биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова Научный руководитель : Доктор биологических наук, профессор Болдырев...»

«УДК 551.509.314(215 – 17) Борисова Алла Семеновна СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ И ПРОГНОЗ ЕСТЕСТВЕННЫХ КОЛЕБАНИЙ ПОЛЕЙ ГЕОПОТЕНЦИАЛА ПОВЕРХНОСТИ 500 ГПА В СЕВЕРНОМ ПОЛУШАРИИ Специальность 25.00.30 – метеорология, климатология, агрометеорология Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата географических наук Санкт – Петербург 2007 2 Диссертация...»

«Адлер Всеволод Эдуардович Классификация дискретных интегрируемых уравнений Специальность 01.01.03 – математическая физика Автореферат диссертации на соискание учёной степени доктора физико-математических наук Черноголовка 2010 Работа выполнена в Учреждении Российской академии наук Институте теоретической физики им. Л.Д. Ландау РАН Официальные оппоненты : доктор физико-математических наук...»

«Кинду Маргарида Франсишко Афонсо (Ангола) СИНТЕЗ И ИССЛЕДОВАНИЕ КООРДИНАЦИОННЫХ СОЕДИНЕНИЙ РЗЭ(III) С НЕКОТОРЫМИ АЗОТСОДЕРЖАЩИМИ ЛИГАНДАМИ И САЛИЦИЛОВОЙ КИСЛОТОЙ Специальность 02.00.01.– неорганическая химия Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук Москва 2012 Работа выполнена на кафедре неорганической химии факультета физико-математических и естественных наук Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего...»

«ПЛЕХАНОВ Сергей Вадимович ИНТЕГРАЦИЯ РАЗНОРОДНЫХ БАЗ ДАННЫХ НА ОСНОВЕ МНОГОМЕРНЫХ МОДЕЛЕЙ ДАННЫХ (на примере интеграции геоинформационной системы с информационными системами предприятия) Специальность 05.13.11 – Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук Уфа 2006 Работа выполнена на кафедре геоинформационных систем Уфимского государственного...»

«Полилова Татьяна Алексеевна ИНФРАСТРУКТУРА РЕГИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАТЕЛЬНОГО ИНТЕРНЕТ-ПРОСТРАНСТВА Специальность: 05.13.11 - Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора физико-математических наук Москва - 2000 Работа выполнена в Институте прикладной математики имени М.В.Келдыша Российской академии наук (г.Москва) Официальные доктор технических наук оппоненты:...»

«Чжэн Цзяньган ПРОСТРАНСТВЕННО-ВРЕМЕННАЯ ЭВОЛЮЦИЯ ЖЕСТКО СФОКУСИРОВАННЫХ МЕГАВАТТНЫХ ФЕМТОСЕКУНДНЫХ СВЕТОВЫХ ПАКЕТОВ В ПРОЗРАЧНОЙ КОНДЕНСИРОВАННОЙ СРЕДЕ. УПРАВЛЕНИЕ ПАРАМЕТРАМИ МИКРОМОДИФИКАЦИЙ СРЕДЫ Специальность 01.04.21 – лазерная физика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва 2007 Работа выполнена на физическом факультете Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова. Научный руководитель : доктор...»

«ПАНЧЕНКО АЛЕКСЕЙ ВИКТОРОВИЧ МАРКШЕЙДЕРСКАЯ ОЦЕНКА УСТОЙЧИВОСТИ КРИВОЛИНЕЙНОГО В ПЛАНЕ БОРТА КАРЬЕРА Специальность 25.00.16 – Горнопромышленная и нефтегазопромысловая геология, геофизика, маркшейдерское дело и геометрия недр Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук Санкт-Петербург– 2014 Работа выполнена в федеральном государственном бюджетном образовательном учреждении высшего профессионального образования Национальный минерально-сырьевой...»

«Шинкевич Сергей Александрович ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ЭЛЕМЕНТАРНЫХ ЧАСТИЦ ВО ВНЕШНИХ ПОЛЯХ И СРЕДАХ МЕТОДОМ ТОЧНЫХ РЕШЕНИЙ Специальность 01.04.02 – теоретическая физика Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва 2007 Работа выполнена на кафедре теоретической физики физического факультета Московского государственного университета им. М. В. Ломоносова. Научный руководитель : Доктор физико-математических наук,...»

«УДК 621.378.373:535 САПАЕВ УСМАН КАЛАНДАРОВИЧ УПРАВЛЕНИЕ ПАРАМЕТРАМИ ЛАЗЕРНОГО ИЗЛУЧЕНИЯ ПРИ ГЕНЕРАЦИИ ГАРМОНИК В ОДНОРОДНЫХ, ПЕРИОДИЧЕСКИХ И АПЕРИОДИЧЕСКИХ КРИСТАЛЛАХ 01.04.21 – Лазерная физика АВТОРЕФЕРАТ диссертация на соискание ученой степени доктора физико-математических наук Ташкент – 2011 Работа выполнена в Институте электроники им. У.А. Арифова Академии наук Республики Узбекистан доктор физико-математических наук,...»

«Сенюкова Ольга Викторовна Разработка алгоритмов семантической сегментации и классификации биомедицинских сигналов низкой размерности на основе машинного обучения Специальность 05.13.11 – математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва – 2012 Работа выполнена на кафедре автоматизации систем вычислительных комплексов факультета...»

«Бутюгин Дмитрий Сергеевич Методы моделирования гармонических электромагнитных полей 05.13.18 – Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Новосибирск – 2013 Работа выполнена на кафедре Вычислительной математики Федераль­ ного государственного бюджетного образовательного учреждения выс­ шего профессионального образования “Новосибирский национальный...»

«УДК 512.643, 512.552 Маркова Ольга Викторовна ФУНКЦИЯ ДЛИНЫ И МАТРИЧНЫЕ АЛГЕБРЫ 01.01.06 математическая логика, алгебра и теория чисел АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук Москва, 2009 Работа выполнена на кафедре высшей алгебры Механико-математического факультета Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова....»














 
© 2013 www.diss.seluk.ru - «Бесплатная электронная библиотека - Авторефераты, Диссертации, Монографии, Методички, учебные программы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.